Une question majeure pour l’Eglise Catholique d’aujourd’hui est celle de son rapport au Peuple Juif et à la Tradition juive. La déclaration Nostra Aetate §4 du Concile Vatican II (en 1965) tint à souligner le « lien qui unit spirituellement » chrétiens et Juifs, le « grand patrimoine spirituel commun » aux uns et aux autres ; ainsi « l’Eglise reconnaît que l’origine de sa foi et de son élection se trouve, selon le dessein de Dieu, chez les Patriarches, Moïse et les Prophètes ». Par la suite, divers documents ecclésiaux sont venus confirmer la volonté de l’Eglise Catholique d’ouvrir une nouvelle page dans ses relations avec le Peuple juif suite à des siècles marqués plutôt par l’ignorance mutuelle et l’hostilité. Diverses instances de dialogue entre Juifs et Chrétiens existent déjà, mais le dialogue ne s’approfondit et devient fructueux que s’il est basé sur une véritable connaissance mutuelle. D’où la nécessité d’un travail d’approfondissement et de recherche, de type pluridisciplinaire, intégrant critique historique, réflexion philosophique, analyse textuelle et littéraire des sources juives et chrétiennes, élucidation du contexte dans lequel ces mêmes textes furent composés. Le département Judaïsme et Christianisme voudrait permettre à des chercheurs juifs et chrétiens de mener ensemble un tel travail de recherche, avec les étudiants qui acceptent de s’y engager.

En vue de la mise en œuvre de ce projet, un partenariat de recherche a été instauré entre le Collège des Bernardins et l’Institut Universitaire d'Etudes Juives Elie Wiesel (IUEJ).

Le thème retenu pour l’année 2010-2011 est celui de "l’altérité".

Le travail s’effectue dans le cadre de séminaires mensuels, destinés principalement à des chercheurs, à des doctorants ou à des étudiants de niveau master. Les comptes rendus des séances sont disponibles sur le site, mais  pour participer aux travaux du séminaire, il est nécessaire d’en faire la demande  par courrier électronique à l’adresse suivante :
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Un colloque aura lieu au courant de l’année académique 2011-2012, avec l’objectif de communiquer au grand public les fruits de la recherche. En amont du colloque, des tables rondes, des soirées et des conférences pourront être organisées pour permettre au plus grand nombre de tirer profit de la réflexion en cours.